المجلس العالمي لحماية الطيور (Bird Life International)
تعد الجمعية الملكية لحماية الطبيعة أول شريك للمجلس العالميلحماية الطيور في منطقة الشرق الأوسط،، وذلك بسبب تطابق الرؤى بين المؤسستين في الحفاظ على الطيور والأماكن التي تعيش فيها، وقد تعاونت المؤسستان في العديد من البرامج لتحقيق هذه الأهداف، كما وتصنف المحميات الطبيعية القائمة والمقترحة من المناطق المهمة للطيور في الأردن حسب معايير المجلس العالمي لحماية الطيور.
الإتحاد الدولي لصون الطبيعة (IUCN)
تعد الجمعية الملكية لحماية الطبيعة من الأعضاء المهمين في الإتحاد الدولي لصون الطبيعة، وهو من أكبر المنظمات العالمية التي تختص بحماية البيئة حول العالم، وقد ساهمت الجمعية في إنشاء المكتب الإقليمي للإتحاد الدولي في عمان حيث تشمل نشاطات هذا المكتب كافة دول غرب آسيا والشرق الأوسط، ولقد قام المكتب الإقليمي للإتحاد الدولي لصون الطبيعة في عمان بتوقيع مذكرة تفاهم مع الجمعية الملكية لحماية الطبيعة في العام 2005، وبالإضافة لذلك فإن الإتحاد الدولي شريك للجمعية في مشروع الإدارة المتكاملة للنظم البيئية في وادي الأردن، وأحد ممولي المشروع من خلال الدعم الفني المباشر.
الصندوق الدولي للرفق بالحيوان (IFAW)
وقعت الجمعية الملكية لحماية الطبيعة والصندوق الدولي للرفق بالحيوان مذكرة تفاهم في شهر أيار من العام 2006. تهدف المذكرة لتنفيذ العديد من النشاطات التي تعنى بحماية التنوع الحيوي في الأردن ومن ابرز تلك النشاطات، بناء قدرة العاملين في مجال تطبيق اتفاقية تنظيم الاتجار بالأحياء البرية المهددة بالانقراض، من خلال برامج تدريبية تنفذها الجمعية وممولة من الصندوق تستهدف موظفي الجمارك والهيئات المختلفة في كافة الدول العربية، إضافة إلى تنفيذ الأسبوع العالمي لحماية الحيوانات بشكل سنوي، بهدف رفع الوعي لدى شرائح المجتمع المختلفة وخصوصا الطلاب، كما يقوم الصندوق بدعم عملية حماية الأحياء البرية من خلال دعم مفتشي الجمعية والشرطة البيئية.