تعمل الجمعية الملكية لحماية الطبيعة مع مجموعة من الشركاء والممولين على تنفيذ العديد من المشاريع والمبادرات والتي ساهمت في نقل برامج الجمعية نقلة نوعية في مجال برامج إدارة التنوع الحيوي ومشاريع السياحة البيئية والتنمية الاقتصادية الاجتماعية، وقد ساهمت هذه المشاريع في أن تلعب الجمعية دور الريادة في إدارة المحميات الطبيعية واستخدام السياحة البيئية والمشاريع الاقتصادية الاجتماعية كوسيلة لتحقيق أهداف حماية الطبيعة.
- مشروع الزراعة العضوية
- مشروع النظم الإيكولوجية وسبل كسب العيش في البادية الأردنية (BELP)
- مشروع مع برنامج الأمم المتحدة الإنمائي بهدف تطوير نظام معلومات ومراقبة وطني خاص بالتنوع الحيوي ضمن مشروع دمج حماية التنوع الحيوي في قطاع السياحة - BIMS
- مشروع إطلاق طائر الحبارى في موطنه ضمن مناطق المملكة الأردنية الهاشمية
- مشروع تطوير مرافق السياحة البيئية في المحميات الطبيعية